Embora subconjuntos sejam geralmente usados para especificar conteúdo para inclusão, algumas situações podem requerer que determinados componentes sejam excluídos de outro conjunto. A exclusão de conjuntos do SNOMED CT pode servir para evitar que certos conceitos apareçam em determinados itens de pesquisa e entrada de dados.
Como em todo subconjunto de componentes do SNOMED CT, é possível definir o subconjunto para exclusão intensionalmente ou extensionalmente. Isso é ilustrado pela figura abaixo. Quando intensionalmente definido, um conjunto de referências com especificação de consultas pode ser usado para a definição intensional, e um conjunto de referências simples pode ser usado para a expansão do conjunto.
Figura 3.2.1.3-1: Subconjuntos para a exclusão de conteúdo podem ser definidos intensionalmente ou extensionalmente
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